Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RPL5P33-201ENST00000487833 905 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC097460.2-201ENST00000511857 741 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CTF1Q16619 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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CTF1Q16619 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTF1Q16619 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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