Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CHCHD4P5-201ENST00000436684 427 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL022157.1-201ENST00000439622 665 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC018521.4-201ENST00000578239 531 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 TUBBP10-201ENST00000427668 1301 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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