Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms