Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TOP3AQ13472 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms