Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NPM1P36-201ENST00000415681 835 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms