Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
FGD1P98174 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.2 ms