Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXD10P28358 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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