Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
APOC4-APOC2K7ER74 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms