Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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