Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RFTN1Q14699 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms