Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
TCOF1Q13428 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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TCOF1Q13428 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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TCOF1Q13428 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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