Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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