Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
TRAF1Q13077 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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TRAF1Q13077 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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