Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SREBF2Q12772 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms