Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPS29P62273 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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