Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRCP08575 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRCP08575 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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PTPRCP08575 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTPRCP08575 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTPRCP08575 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTPRCP08575 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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PTPRCP08575 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRCP08575 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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