Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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USP29Q9HBJ7 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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