Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms