Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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NDUFA9Q16795 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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NDUFA9Q16795 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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NDUFA9Q16795 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NDUFA9Q16795 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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