Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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