Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CBFBQ13951 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms