Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ITGB3BPQ13352 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
ITGB3BPQ13352 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms