Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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PTP4A2Q12974 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PTP4A2Q12974 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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