Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
HOXD10P28358 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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