Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
VAX2Q9UIW0 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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VAX2Q9UIW0 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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VAX2Q9UIW0 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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VAX2Q9UIW0 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
VAX2Q9UIW0 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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