Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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COPS7AQ9UBW8 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COPS7AQ9UBW8 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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