Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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SYNE4Q8N205 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SYNE4Q8N205 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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