Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms