Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FSCN1Q16658 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms