Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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CDH18Q13634 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CDH18Q13634 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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