Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SP140Q13342 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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SP140Q13342 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SP140Q13342 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SP140Q13342 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SP140Q13342 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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