Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms