Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXD4Q12950 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FOXD4Q12950 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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