Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SRSF4Q08170 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms