Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
PTPRCP08575 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms