Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ERVV-1B6SEH8 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms