Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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USP18Q9UMW8 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
USP18Q9UMW8 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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