Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CTXN3Q4LDR2 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms