Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PDK4Q16654 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PDK4Q16654 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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