Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms