Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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PUM3Q15397 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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PUM3Q15397 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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PUM3Q15397 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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PUM3Q15397 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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PUM3Q15397 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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PUM3Q15397 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PUM3Q15397 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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