Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PKIA-AS1-201ENST00000519242 995 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CUL3Q13618 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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