Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
PICALMQ13492 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PICALMQ13492 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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