Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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TCOF1Q13428 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TCOF1Q13428 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
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