Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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NME3Q13232 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
NME3Q13232 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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