Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD13P35453 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD13P35453 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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