Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PRKCHP24723 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms