Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
UBXN4Q92575 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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UBXN4Q92575 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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UBXN4Q92575 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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UBXN4Q92575 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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UBXN4Q92575 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 COX6C-210ENST00000524245 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
UBXN4Q92575 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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