Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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CCDC142Q17RM4 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC142Q17RM4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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