Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
ECM1Q16610 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms